Prediction of Seven Candidate Transcription Factors in B-Cell Acute Lymphoblastic Leukemia Using System Biology Approaches
Journal Title: مجله علمی- پژوهشی دانشگاه علوم پزشکی قم - Year 2018, Vol 12, Issue 1
Abstract
Background and Objectives: Acute lymphoblastic leukemia is caused by damage to self DNA leading to uncontrolled cellular growth. The aim of this study was to find out a new appropriate diagnostic and therapeutic methods using differential gene expression and protein analyzes in different methods of the biology system. Methods: Microarray library GSE20011 was downloaded from GEO database and analyzed using GEO2R software. In this study, two groups of control (with benign Hodgkin lymphoma) and treatment (with acute lymphoblastic leukemia of B cells), were compared with each other. In BALL cancer, 338 genes were up-regulated and 252 genes were down-regulated, that analyzes of protein kinases, transcription factors, gene function, protein-protein interaction, and finally, drawing differential genes protein network, were performed by KEA, ChEA, DAVID, Gene2Network, and yEd databases, respectively. Results: In this study, for the first time, seven transcription factors LYL1, SPI1, TET1, POU3F2, LMO2, CUX1, and ELF1, were reported as the candidate for diagnosis and treatment for BALL. Also, the importance of the role of membrane in BALL cells with the function of 97 up-regulated genes increased from the total 338 genes in cell membranes, showed the importance of membrane protection; and 97 genes were identified in cell resistance function for BALL cells, which can be interpreted as high resistance of BALL cells to molecular-based therapeutic approaches. Conclusion: The results of this study can help to better understand the cellular resistance mechanism of BALL to treatment and provided seven candidate proteins for diagnosis and possibly treatment.
Authors and Affiliations
Elham Elham, Ghasem Ghasem, Fatemeh Fatemeh, Ali Ali
Keywords
Related Articles
- EP ID EP467968
- DOI 10.29252/qums.12.1.1
- Views 185
- Downloads 0
گزارش خونریزی داخل مغزی درپی درمان سکته قلبی
زمینه و هدف: سکته مغزی از عوارض نادر بعد از سکته قلبی است. از درمان‌های دارویی سکته قلبی منجر به سکته مغزی می‌توان به آسپرین، پلاویکس و انوکساپارین اشاره کرد. مطالعه حاضر گزارش موردی سکته مغزی به دنبال سکته قلبی است که...
Effect of Aflatoxin B1 on Histomorphometric Parameters of Testis in Male Mature Albino Mouse
Background and Objectives: Aflatoxin B1 (AFB1) is a mycotoxin, which is produced by Aspergillus flavus and Aspergillus parasiticus. Among four types of AFB (AFB1, AFB2, AFB3, and AFN4), AFB1 is the most abundant and toxi...
اثر تمرین استقامتی بر واسپین و شاخص‌های قندی موش‌های صحرایی مبتلا به دیابت
زمینه و هدف: واسپین، آدیپوکینی است که از بافت چربی احشایی موش صحرایی، جدا و شناسایی شده است. در مطالعه حاضر اثر تمرین استقامتی با شدت متوسط و بالا بر واسپین و شاخص‌های قندی موش‌های صحرایی مبتلا به دیابت بررسی گردید. روش...
بررسی شیوع ویروس هپاتیت B و C در بیماران هموفیلی استان قم
زمینه و هدف: هموفیلی یک بیماری خونریزی‌دهنده ارثی است که برای پیشگیری و درمان حدود 70% مبتلایان به آن، از CFC (Clotting Factor Concentration) استفاده می‌شود. این مسئله می‌تواند نقش مهمی در انتقال ویروس‌های منتقله از راه...
ارزیابی خودکارآمدی پژوهشی و عوامل مرتبط با آن در دانشجویان رشته های علوم پزشکی شاغل به تحصیل دانشگاه آزاد اسلامی واحد قم در سال 1395 معاونت پژوهش دانشگاه آزاد اسلامی قم
زمینه و هدف: احساس اطمینان دانشجویان نسبت به توانایی ها و تصور آن ها از مهارت های پژوهشی،از مهم ترین عوامل موثر بر انجام پژوهش می باشد. این مطالعه با هدف ارزیابی خودکارآمدی پژوهشی و عوامل مرتبط با آن در دانشجویان رشته ها...