Çoklu-İlaç Dirençli P. aeruginosa ve E.coli Suşlarında Antibiyotik Direnç Genlerinin ve Sınıf 1 İntegron Gen Kasetlerinin Araştırılması
Journal Title: Cumhuriyet Science journal - Year 2018, Vol 39, Issue 4
Abstract
P. aeruginosa ve E.coli izolatlarının birçok antibiyotiğe direnç kazanması nedeniyle bu patojenlerin neden olduğu enfeksiyonların tedavisi zorlaşmıştır. Bundan dolayı klinik izolatlarda antibiyotik direnç genlerinin belirlenmesi büyük önem arz etmektedir. Bu çalışmanın amacı çoklu-ilaç dirençli P. aeruginosa ve E.coli klinik suşlarında beta laktamaz direnç genlerinin ve sınıf 1 integronlar gen kasetlerinin varlığının araştırılmasıdır. Gümüşhane Devlet Hastanesi yoğun bakım ünitesinde yatan hastaların kan, idrar ve balgam örneklerinden izole edilen 2 P. aeruginosa ve 2 E.coli izolatlarının tanımlaması ve antibiyogramı Vitek 2 Compact otomatize sistemi ile çalışılmıştır. Total DNA izolasyonu kaynatma DNA metoduyla yapılmıştır. blaVIM, blaNDM, blaIMP, blaGES, blaCTXM-1, blaCTXM-2, blaOXA-58, blaOXA-23, blaOXA-51, blaOXA-40, blaKPC ve sınıf 1 integron gen kasetlerine ait primerler kullanılarak PZR’ler gerçekleştirilmiştir. Amplikasyonun gerçekleştiği tüm örnekler %1’lik agaroz jelde yürütülmüştür ve daha sonra UV ışığında görünür hale getirilmiştir. Antibiyogram sonucuna göre P. aeruginosa izolatları gentamisin hariç kullanılan tüm antibiyotiklere karşı direnç gösterdiği belirlenmiştir. E.coli izolatlarının ise karbapenemlere karşı duyarlı sefalosporin grubu antibiyotiklere karşı dirençli olduğu görülmüştür. Sınıf A beta laktamaz genlerinden blaCTXM-1 4 suşun 3’ünde bulunurken, hiçbir suşta blaCTXM-2, blaKPC ve blaGES genleri tespit edilmemiştir. Araştırılan sınıf B ve sınıf D beta laktamaz genlerinin varlığı hiçbir örnekte görülmemiştir. 3 suşta sınıf 1 integronun varlığı tespit edilmiştir. DNA dizi analiz sonucuna göre üç integron pozitif örneğin dfrA17/AadA5 gen kasetine sahip olduğu belirlenmiştir.
Authors and Affiliations
Azer ÖZAD DÜZGÜN, Ayşegül SARAL
Keywords
Related Articles
- EP ID EP488414
- DOI 10.17776/csj.409136
- Views 196
- Downloads 0
Surface Energy Coefficient Determination in Global Mass Formula from Fission Barrier Energy
Semi-empirical mass formulae of the atomic nucleus describe binding energies of the nuclei. In the simple configuration and pattern of this formula, there are five terms related to the properties of the nuclear structure...
Simulation by Geant4 of hadrontherapy beam line
Hadrontherapy represents a pioneer technique, and only few centers worldwide can provide this advanced and specialized cancer treatment. Geant4 (GEometry ANd Tracking 4) is a C++, free and open toolkit that used to simul...
Supramolecular Solvent-Based Microextraction of Propachlor and Prometryn Herbicides in Soil Samples Prior to Liquid Chromatographic Analysis
Supramolecular solvents (SUPRASs) are the nano-structured liquids generated from amphiphiles through a self-assembly process, and constitute an alternative to molecular organic solvents with becoming more environmentally...
Altitude Triggers Some Biochemical Adaptations of Polygonum cognatum Meissn. Plants
Madimak is a local name of Polygonum cognatum which is known as a nutrient- and phenolic-rich edible plant in Turkish traditional cuisine. Knotweed (madimak) is usually found in both agricultural and non-agricultural are...
Thickness Dependent Dielectric Loss of Plasma Poly (Ethylene Oxide) Films
Dielectric properties of plasma poly (ethylene oxide) (pPEO) thin film samples were investigated at room temperature. The thin film samples with different thicknesses were deposited by plasma assisted physical vapor depo...