Çoklu-İlaç Dirençli P. aeruginosa ve E.coli Suşlarında Antibiyotik Direnç Genlerinin ve Sınıf 1 İntegron Gen Kasetlerinin Araştırılması
Journal Title: Cumhuriyet Science journal - Year 2018, Vol 39, Issue 4
Abstract
P. aeruginosa ve E.coli izolatlarının birçok antibiyotiğe direnç kazanması nedeniyle bu patojenlerin neden olduğu enfeksiyonların tedavisi zorlaşmıştır. Bundan dolayı klinik izolatlarda antibiyotik direnç genlerinin belirlenmesi büyük önem arz etmektedir. Bu çalışmanın amacı çoklu-ilaç dirençli P. aeruginosa ve E.coli klinik suşlarında beta laktamaz direnç genlerinin ve sınıf 1 integronlar gen kasetlerinin varlığının araştırılmasıdır. Gümüşhane Devlet Hastanesi yoğun bakım ünitesinde yatan hastaların kan, idrar ve balgam örneklerinden izole edilen 2 P. aeruginosa ve 2 E.coli izolatlarının tanımlaması ve antibiyogramı Vitek 2 Compact otomatize sistemi ile çalışılmıştır. Total DNA izolasyonu kaynatma DNA metoduyla yapılmıştır. blaVIM, blaNDM, blaIMP, blaGES, blaCTXM-1, blaCTXM-2, blaOXA-58, blaOXA-23, blaOXA-51, blaOXA-40, blaKPC ve sınıf 1 integron gen kasetlerine ait primerler kullanılarak PZR’ler gerçekleştirilmiştir. Amplikasyonun gerçekleştiği tüm örnekler %1’lik agaroz jelde yürütülmüştür ve daha sonra UV ışığında görünür hale getirilmiştir. Antibiyogram sonucuna göre P. aeruginosa izolatları gentamisin hariç kullanılan tüm antibiyotiklere karşı direnç gösterdiği belirlenmiştir. E.coli izolatlarının ise karbapenemlere karşı duyarlı sefalosporin grubu antibiyotiklere karşı dirençli olduğu görülmüştür. Sınıf A beta laktamaz genlerinden blaCTXM-1 4 suşun 3’ünde bulunurken, hiçbir suşta blaCTXM-2, blaKPC ve blaGES genleri tespit edilmemiştir. Araştırılan sınıf B ve sınıf D beta laktamaz genlerinin varlığı hiçbir örnekte görülmemiştir. 3 suşta sınıf 1 integronun varlığı tespit edilmiştir. DNA dizi analiz sonucuna göre üç integron pozitif örneğin dfrA17/AadA5 gen kasetine sahip olduğu belirlenmiştir.
Authors and Affiliations
Azer ÖZAD DÜZGÜN, Ayşegül SARAL
Keywords
Related Articles
- EP ID EP488414
- DOI 10.17776/csj.409136
- Views 147
- Downloads 0
On the Solution of An Ill-Posed Boundary Value Problem for Second-Order Evolution Equations
In this work, we deal with an ill-posed boundary value problem for multidimensional second-order evolution equations with variable coefficients. By using the given data, we reduce the problem to a functional equation and...
Structural Characterization of 6-Bromo-5-nitroquinoline-1-oxide: A Quantum Chemical Study and XRD Investigations
The chemical properties of recently synthesized 6-bromo-5-nitroquinoline-1-oxide under a mild reaction condition by regioselective nitration of 6-bromoquinoline-1-oxide at C5 on going our research were investigated as th...
Theoretical Study on Flavonoids Isolated from Allium vineale
The chemical properties of chrysoeriol-7-O-[2''-O-E-feruloyl]-β-D-glucoside (1), chrysoeriol (2), and isorhamnetin-3-β-D-glucoside (3) from Allium vineale have been investigated as theoretical. RHF/STO-3G method was used...
Usage of BV Seeds as an Alternative Pre-crystallization Technique in Production of Synbiotic Sugar-free Dark Chocolate: Effect of Quality Characteristics
Pre-crystallization process in chocolate production requires high investment cost and it is employed with multistage thermal processes. Improper tempering process results in fat bloom main quality defect of the chocolate...
Design of Reversed Phase Chromatography (RPC) Column Packing Material for Protein Separation: Part 1- Synthesis and Characterization
In the first part of the two-part study, the column packed materials in the form of monodisperse and porous particles were synthesized with regard to test their column performances in Reverse Phase Chromatography (RPC)....