Изучение полиморфизма гена MDP0000151428 среди сортов и видов яблони
Journal Title: Фактори експериментальної еволюції організмів - Year 2018, Vol 22, Issue
Abstract
Цель. Целью данной работы было изучение вариабельности гена MDP0000151428, относящегося к DREB семейству, среди сортов различного генетического происхождения, обладающих разной устойчивостью к холоду. Методы. Анализ полиморфизма проводили с помощью методов ПЦР и секвенирования. Результаты. Проведены клонирование и секвенирование гена MDP0000151428 из 18 сортов и видов яблони с различным уровнем устойчивости к холоду. Оценка вариабельности его первичной структуры показала присутствие точечных мутаций. Большинство из них являлись однонуклеотидными заменами, в одном случае обнаружена однонуклеотидная делеция. Степень идентичности последовательностей колебалась от 97,5 % до 100 %. Выводы. Оценка полиморфизма длины гена MDP0000151428 показала, что он достаточно консервативен и не несет протяженных инсерций или делеций у 20 сортов и видов яблони с различным уровнем устойчивости к холоду. Анализ показал, что частота возникновения мутаций в различных сайтах гена MDP0000151428 различается. Наиболее подвержены мутациям нуклеотиды, находящиеся в 138, 341 и 472 позициях. Сравнение гипотетических аминокислотных последовательностей показало наличие отдельных замен. Чаще всего они встречаются в 114 и 158 позициях. Ключевые слова: яблоня, ген MDP0000151428, транскрипционные факторы, устойчивость к холоду.
Authors and Affiliations
О. Ю. Урбанович, П. В. Кузмицкая
Keywords
Related Articles
- EP ID EP618755
- DOI -
- Views 40
- Downloads 0
Cloning of sequence of homologous crt-cluster in Streptomyces globisporus 1912-бп
Aim. The aim was to set influence to the additional homologous crt-cluster on carotenogenesis of cells of streptomycete recipient. Methods. For this purpose transformation by the hybrid plasmid pWC 9,6 was conducted. Thi...
Assessment of structural peculiarities of glaziovianin A interaction with human α-, β and γ-tubulins
Aim. To determine the features of the ligand-protein interaction of glaziovianin A and human α-, β- and γ-tubulin. Methods. Protein and ligand spatial structure modelling (I-Tasser, Grid), molecular docking (CCDC Gold),...
PTEN-dependent changes of gene expressions in human prostate tumors
Aim. To determine the levels of PTEN relative expression (RE) and the possible effects of its loss on some tumor-associated genes and histological characteristics of human prostate tumors. Methods. PTEN RE and 46 genes w...
Адаптація рослин кукурудзи до хронічного ультрафіолетового опромінення
Мета. Досліджена адаптація молодих рослин кукурудзи (Zea mays L.) до дії хронічного ультрафіолету В (УФ-В) опромінення в період вегетативного росту та формування фотосинтетичного апарату листків. Методи. Рослини кукурудз...
Study of prevalence of different forms of ichthyosis in Kharkiv region
Ichthyosis is genetically and clinically heterogenic group of epidermis keratinization disorders. Its prevalence is geographically different. Aim. The aim of this research was to evaluate ichthyosis prevalence in Kharkiv...