Варіабельність генів CYP4 i CYP6 у попелиці Aphis fabae mordvilkoi Börner & Janisch, 1922
Journal Title: Фактори експериментальної еволюції організмів - Year 2018, Vol 22, Issue
Abstract
Мета. Оцінити варіабельність генів CYP450 4-го і 6-го сімейств, витягнутих їхніх даних про повногеномне секвенування попелиці Aphis fabae mordvilkoi, що розвивається в Білорусі, на бузок (Philadelphus coronaries L.). Методи. Секвенування генома попелиць провели в Центрі секвенування ДНК Університету штату Юта (Солт-Лейк-Сіті, США). Послідовності генів CYP4 і CYP6 були витягнуті з пулу прочиток генома шляхом послідовної фільтрації вирівнювань прочиток по референсним послідовностям генів CYP450 4-го і 6-го сімейства, витягнутих з 3 знаходяться у відкритому доступі геномів попелиць (Acyrthosiphon pisum Harris, 1776, Myzus persicae (Sulžer, 1776) і Diuraphis noxia (MordvilkoexKurdjumov, 1913)). Всі виявлені унікальні варіанти збірки оцінювали як індивідуальний ген. Результати. У геномі A. fabae mordvilkoi виявлений 31 ген CYP4, з яких 24 є варіанти гена CYP4C1. У сімействі CYP6 виявлено 19 генів, 8 з яких є варіанти CYP6A13. Варіабельність нуклеотидних і амінокислотних послідовностей CYP4 і CYP6 у A. fabae mordvilkoi виявилася, рівною мірою, високою. Висновки. У геномі попелиці A. fabae mordvilkoi серед генів CYP450 сімейства CYP4 переважають гени CYP4C1, а гени CYP6 представлені переважно генами CYP6A13. Решта гени зазначених родин представлені в геномі A. fabae mordvilkoi одиничними копіями.Ключові слова: попелиці, цитохроми р450, Aphis fabae, трофічна спеціалізація, копійність генів.
Authors and Affiliations
Н. В. Воронова, М. М. Воробьева, Ю. В. Бондаренко
Keywords
Related Articles
- EP ID EP618722
- DOI -
- Views 63
- Downloads 0
Глобалізація в голштинізації: досягнення і генетичні небезпеки
Мета. Великомасштабна селекція ґрунтується на використанні сучасних досягнень популяційної генетики, створенні автоматизованих інформаційних систем за допомогою електронно-обчислювальної техніки, моделюванні й оптимізаці...
The protein expression changes during the signaling systems interaction in stressed pea seedlings
Aim. The plant’s signaling systems functioning under stress impact is expressed in changes of the genes expression and protein synthesis. The purpose of this study is to investigate the effect of stressors and their comb...
Генетичні маркери молдавських цигайських і каракульських овець
Мета. Вивчення генетичної структури двох створених молдавських типів овець – цигайських шерстно-м’ясо-молочного і каракульсь смушково-м’ясо-молочного типів за частотою антигенів, генотипів, алелів, рівнем гомозиготності...
Association of TP53 Arg72Pro polymorphism (rs1042522) with bladder cancer risk in the Ukrainian population
Aim. To determine the frequency of TP53 polymorphic variants in bladder cancer patients and define possible association of this polymorphism with a bladder cancer in Ukrainians patients. Methods. The genotypes of TP53 ge...
Поліморфізм в регіоні, що передує кодуючій ділянці гена Ppd-D1, у Aegilops tauschii Coss.
Мета. Оцінити вплив поліморфізмів в регіоні, що передує кодуючій ділянці гена Ppd-D1, на строки колосіння та цвітіння в колекційних зразках Aegilops tauschii Coss., донора геному D м'якої пшениці. Методи. Виділення ДНК,...