Zastosowanie analizy ‘multiplex PCR’ do identyfikacji męsko-sterylnej cytoplazmy typu ogura oraz genu restorera Rfo w materiałach hodowlanych rzepaku
Journal Title: Rośliny Oleiste - Oilseed Crops - Year 2010, Vol 31, Issue 2
Abstract
Ze względu na opracowanie dla rzepaku systemów męskiej sterylności pozwalających na kontrolę zapylenia krzyżowego wzrasta zainteresowanie hodowców odmianami mieszańcowymi tej rośliny. W Krajowym Rejestrze COBORU wpisanych jest 111 odmian rzepaku, w tym 87 odmian ozimych, z których 35 stanowią odmiany mieszańcowe. Mieszańce zrestorowane F1 oraz linie restorerów nie różnią się fenotypowo od odmian podwójnie ulepszonych, dlatego w celu monitorowania obecności męsko-sterylnej cytoplazmy (CMS) typu ogura oraz genu restorera Rfo stosowano niezależnie dwa markery genetyczne, specyficzne dla CMS ogura (marker SCAR, około 500 par zasad) i genu Rfo (marker SCAR, 1 100 pz). W celu zwiększenia efektywności i obniżenia kosztów prowadzonych analiz zaadaptowano podejście w oparciu o metodę multiplex PCR, polegającą na jednoczesnej analizie obu markerów SCAR zamplifikowanych w jednej PCR. Dodatkowo, włączono kontrolę wewnętrzną polegającą na amplifikacji metodą PCR zachowawczego fragmentu cDNA aktyny (marker SCAR, 600 pz), stanowiącej białko powszechnie występujące w strukturach komórkowych. Dzięki temu wyeliminowano fałszywe wyniki negatywne, spowodowane degradacją analizowanego DNA, złą jakością odczynników lub błędem podczas wykonywania reakcji. Przy użyciu metody multiplex PCR przeanalizowano 208 prób DNA uzyskanych z mieszańców F1, linii restorerów oraz form hodowlanych rekombinantów. Równolegle prowadzono badania z zastosowaniem dwóch markerów w niezależnych reakcjach, co potwierdziło skuteczność metody. Znajdzie ona szerokie zastosowanie do rutynowych analiz w hodowli mieszańcowej i rekombinacyjnej.
Authors and Affiliations
Katarzyna Mikołajczyk, Agnieszka Dobrzycka, Jan Podkowiński, Wiesława Popławska, Stanisław Spasibionek, Iwona Bartkowiak-Broda
Keywords
Related Articles
- EP ID EP59605
- DOI -
- Views 101
- Downloads 0
Competition between plants on adjacent plots in the field trial on the winter oilseed rape ([i]Brassica napus[/i] L.) 2. An attempt to eliminate the impact of competition between plants growing on neighboring plots on the seed yield from the plot by statistical calculations
The results of field trials with winter oilseed rape are biased by the effects of competition between plants growing on adjacent plots. We tried to remove the impact of these effects using analysis of regression. The pro...
Domestic Oilseed Market in the season of 2009/2010 (prognosis)
In 2009 rapeseed crop in Poland amounted to record level of ca 2.5 million tons. The supply of rapeseed on the internal and European market considerably outpaced the demand and therefore rapeseed prices declined. If the...
Zależności pomiędzy wybranymi cechami jakościowymi nasion soi a ich zasiedleniem przez grzyby
Materiał badawczy stanowiło 15 prób nasion soi. Określono masę tysiąca nasion, ciężar objętościowy, ilość zanieczyszczeń, pH, wilgotność, aktywność wody (aw), zawartość tłuszczu, kwasowość tłuszczu oraz wilgotność krytyc...
Content of essential oil and its composition in fruit originated from caraway (Carum carvi L.) collection
In 2007–2009, the caraway collection consisted of 22 objects (18 populations from European botanical gardens — named according to localizations of gardens, cultivar: Kończewicki and three strains from our own breeding pr...
Ocena mieszanek z dużym udziałem makuchów z nowych odmian rzepaku dla kurcząt brojlerów
W badaniach oceniano mieszanki, w których część poekstrakcyjnej śruty sojowej zastąpiono makuchami rzepakowymi z odmiany Lirajet, Kana i Marita. Doświadczenie I przeprowadzono na 120 kurczętach brojlerach Ross 308 podzie...